Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarcc1P97496 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcc1P97496 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcc1P97496 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms