Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Irx1P81068 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx1P81068 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx1P81068 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx1P81068 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx1P81068 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Irx1P81068 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx1P81068 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx1P81068 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms