Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Abcc9P70170 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Abcc9P70170 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Abcc9P70170 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Abcc9P70170 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Abcc9P70170 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Abcc9P70170 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Abcc9P70170 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Abcc9P70170 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Abcc9P70170 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Abcc9P70170 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Abcc9P70170 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Abcc9P70170 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Abcc9P70170 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Abcc9P70170 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Abcc9P70170 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Abcc9P70170 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms