Protein–RNA interactions for Protein: P70168

Kpnb1, Importin subunit beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpnb1P70168 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpnb1P70168 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpnb1P70168 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpnb1P70168 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpnb1P70168 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpnb1P70168 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpnb1P70168 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpnb1P70168 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpnb1P70168 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kpnb1P70168 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Kpnb1P70168 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Kpnb1P70168 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms