Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crip1P63254 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Crip1P63254 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms