Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtnP63089 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtnP63089 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtnP63089 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtnP63089 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtnP63089 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtnP63089 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtnP63089 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtnP63089 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtnP63089 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtnP63089 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtnP63089 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtnP63089 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtnP63089 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtnP63089 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtnP63089 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtnP63089 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtnP63089 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtnP63089 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtnP63089 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtnP63089 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtnP63089 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtnP63089 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtnP63089 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtnP63089 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtnP63089 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtnP63089 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtnP63089 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtnP63089 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtnP63089 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtnP63089 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtnP63089 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtnP63089 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtnP63089 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtnP63089 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtnP63089 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtnP63089 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtnP63089 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtnP63089 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtnP63089 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtnP63089 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtnP63089 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtnP63089 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtnP63089 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtnP63089 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtnP63089 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtnP63089 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtnP63089 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms