Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp2P63044 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp2P63044 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms