Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp3P63024 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms