Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2bP62915 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2bP62915 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms