Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gnb1P62874 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gnb1P62874 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms