Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rps28P62858 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps28P62858 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms