Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl23aP62751 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl23aP62751 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23aP62751 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23aP62751 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23aP62751 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23aP62751 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23aP62751 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23aP62751 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl23aP62751 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms