Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f4P62515 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou3f4P62515 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms