Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Arf6P62331 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arf6P62331 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf6P62331 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf6P62331 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf6P62331 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf6P62331 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf6P62331 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf6P62331 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Arf6P62331 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms