Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd2P62317 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snrpd2P62317 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snrpd2P62317 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms