Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smg6P61406 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smg6P61406 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smg6P61406 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Smg6P61406 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smg6P61406 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smg6P61406 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smg6P61406 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smg6P61406 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smg6P61406 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smg6P61406 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Smg6P61406 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smg6P61406 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smg6P61406 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smg6P61406 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smg6P61406 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smg6P61406 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smg6P61406 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smg6P61406 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smg6P61406 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smg6P61406 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Smg6P61406 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Smg6P61406 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smg6P61406 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smg6P61406 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smg6P61406 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg6P61406 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms