Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2fP61219 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2fP61219 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2fP61219 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2fP61219 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2fP61219 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2fP61219 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2fP61219 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2fP61219 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2fP61219 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2fP61219 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2fP61219 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2fP61219 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2fP61219 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2fP61219 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2fP61219 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2fP61219 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2fP61219 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2fP61219 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Polr2fP61219 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr2fP61219 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms