Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppfia3P60469 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia3P60469 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia3P60469 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms