Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms