Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Actn4P57780 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn4P57780 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Actn4P57780 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn4P57780 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn4P57780 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn4P57780 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms