Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcbp3P57722 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pcbp3P57722 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms