Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdcd5P56812 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdcd5P56812 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms