Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms