Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad23aP54726 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rad23aP54726 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms