Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efnb1P52795 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms