Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ube2e3P52483 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms