Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-1P50220 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx2-1P50220 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx2-1P50220 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms