Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5P49615 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cdk5P49615 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms