Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps4bP46467 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps4bP46467 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps4bP46467 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms