Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nkx1-2P42580 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nkx1-2P42580 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx1-2P42580 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms