Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cap1P40124 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cap1P40124 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cap1P40124 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cap1P40124 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cap1P40124 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cap1P40124 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cap1P40124 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cap1P40124 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cap1P40124 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cap1P40124 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cap1P40124 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cap1P40124 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms