Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptpn1P35821 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn1P35821 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms