Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddit3P35639 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms