Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TpoP35419 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TpoP35419 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpoP35419 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpoP35419 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpoP35419 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TpoP35419 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpoP35419 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpoP35419 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TpoP35419 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TpoP35419 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TpoP35419 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpoP35419 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpoP35419 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpoP35419 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpoP35419 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpoP35419 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpoP35419 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpoP35419 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TpoP35419 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TpoP35419 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TpoP35419 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpoP35419 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpoP35419 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpoP35419 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpoP35419 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms