Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Msr1P30204 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msr1P30204 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms