Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aco1P28271 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aco1P28271 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aco1P28271 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aco1P28271 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aco1P28271 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aco1P28271 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms