Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja8P28236 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja8P28236 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja8P28236 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja8P28236 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja8P28236 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja8P28236 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gja8P28236 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja8P28236 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja8P28236 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja8P28236 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja8P28236 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja8P28236 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja8P28236 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja8P28236 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms