Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gjb3P28231 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb3P28231 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb3P28231 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms