Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gjb1P28230 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb1P28230 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gjb1P28230 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms