Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde6aP27664 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pde6aP27664 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pde6aP27664 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms