Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SarsP26638 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SarsP26638 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarsP26638 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarsP26638 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SarsP26638 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SarsP26638 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarsP26638 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SarsP26638 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SarsP26638 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SarsP26638 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SarsP26638 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SarsP26638 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SarsP26638 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SarsP26638 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SarsP26638 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SarsP26638 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SarsP26638 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SarsP26638 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SarsP26638 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SarsP26638 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SarsP26638 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SarsP26638 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SarsP26638 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SarsP26638 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarsP26638 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarsP26638 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarsP26638 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarsP26638 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarsP26638 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarsP26638 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarsP26638 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarsP26638 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SarsP26638 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SarsP26638 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarsP26638 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarsP26638 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarsP26638 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarsP26638 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarsP26638 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarsP26638 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarsP26638 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarsP26638 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SarsP26638 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarsP26638 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarsP26638 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SarsP26638 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarsP26638 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarsP26638 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarsP26638 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarsP26638 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SarsP26638 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SarsP26638 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SarsP26638 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SarsP26638 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms