Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CftrP26361 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CftrP26361 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CftrP26361 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CftrP26361 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CftrP26361 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CftrP26361 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CftrP26361 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CftrP26361 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CftrP26361 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CftrP26361 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CftrP26361 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CftrP26361 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CftrP26361 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CftrP26361 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CftrP26361 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CftrP26361 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CftrP26361 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CftrP26361 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CftrP26361 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CftrP26361 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CftrP26361 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CftrP26361 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CftrP26361 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CftrP26361 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CftrP26361 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CftrP26361 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CftrP26361 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CftrP26361 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CftrP26361 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CftrP26361 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CftrP26361 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CftrP26361 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CftrP26361 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CftrP26361 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CftrP26361 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CftrP26361 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CftrP26361 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CftrP26361 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CftrP26361 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CftrP26361 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CftrP26361 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CftrP26361 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CftrP26361 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CftrP26361 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CftrP26361 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CftrP26361 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CftrP26361 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CftrP26361 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CftrP26361 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CftrP26361 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CftrP26361 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CftrP26361 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CftrP26361 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CftrP26361 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CftrP26361 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CftrP26361 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CftrP26361 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CftrP26361 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CftrP26361 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CftrP26361 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CftrP26361 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CftrP26361 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
CftrP26361 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CftrP26361 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CftrP26361 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CftrP26361 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CftrP26361 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CftrP26361 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CftrP26361 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CftrP26361 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CftrP26361 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CftrP26361 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CftrP26361 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CftrP26361 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CftrP26361 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CftrP26361 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CftrP26361 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CftrP26361 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CftrP26361 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CftrP26361 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CftrP26361 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CftrP26361 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CftrP26361 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CftrP26361 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CftrP26361 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CftrP26361 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CftrP26361 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CftrP26361 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CftrP26361 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CftrP26361 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms