Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkchP23298 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkchP23298 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkchP23298 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkchP23298 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkchP23298 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkchP23298 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkchP23298 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkchP23298 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkchP23298 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkchP23298 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkchP23298 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms