Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja1P23242 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja1P23242 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gja1P23242 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gja1P23242 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms