Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tap1P21958 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tap1P21958 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tap1P21958 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tap1P21958 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms