Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcer1aP20489 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms