Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rps6ka1P18653 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka1P18653 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rps6ka1P18653 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms