Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18528 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P18528 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18528 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18528 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18528 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P18528 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18528 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18528 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18528 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18528 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18528 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18528 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P18528 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18528 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18528 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18528 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18528 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18528 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18528 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18528 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18528 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18528 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18528 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18528 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18528 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18528 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18528 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18528 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18528 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18528 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18528 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18528 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18528 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms