Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptbp1P17225 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms