Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcna1P16388 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcna1P16388 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna1P16388 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms